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Héctor Cancela nació en Montevideo en 1967. Cursó primaria en las escuelas 195 y 102, y secundaria en los liceos 13, 33 y 10 de Montevideo. Es Ingeniero de Sistemas en Computación, titulado en la Facultad de Ingeniería de la Universidad de la República, y realizó un Doctorado en Informática en la Universidad de Rennes 1, Francia.

Actualmente se desempeña como Profesor Titular del Departamento de Investigación Operativa, Instituto de Computación, Facultad de Ingeniería, y es Investigador Grado 5 del Programa de Desarrollo de las Ciencias Básicas (PEDECIBA).
Sus trabajos de investigación dentro del área de la Investigación Operativa se centran en el desarrollo de modelos matemáticos y su implementación informática para la resolución de problemas en diversas áreas, como el diseño de redes de comunicaciones y de transporte, el manejo de recursos naturales, y la asignación de recursos en el agro, entre otras aplicaciones.